Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc5Q9D0F6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms