Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc47Q9D024 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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