Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Elp3Q9CZX0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms