Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms