Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms