Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssu72Q9CY97 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms