Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ube2fQ9CY34 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2fQ9CY34 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2fQ9CY34 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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