Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mgme1Q9CXC3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms