Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkrip1Q9CWV6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms