Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx10Q9CWT3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx10Q9CWT3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms