Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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