Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NmbQ9CR53 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms