Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms