Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms