Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp6v0e1Q9CQD8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Atp6v0e1Q9CQD8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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