Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms