Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Use1Q9CQ56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Use1Q9CQ56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Use1Q9CQ56 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Use1Q9CQ56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Use1Q9CQ56 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Use1Q9CQ56 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Use1Q9CQ56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms