Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
StambpQ9CQ26 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms