Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms