Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms