Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rrbp1Q99PL5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrbp1Q99PL5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms