Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc4Q99PH1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms