Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim3Q99PE5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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