Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b4Q99ME6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b4Q99ME6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms