Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Emc3Q99KI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Emc3Q99KI3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms