Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dok4Q99KE3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms