Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc8b1Q925Q3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms