Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atad3Q925I1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atad3Q925I1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms