Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spdl1Q923A2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms