Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Pde6cQ91ZQ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde6cQ91ZQ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Pde6cQ91ZQ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pde6cQ91ZQ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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