Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trpm2Q91YD4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpm2Q91YD4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms