Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Basp1Q91XV3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Basp1Q91XV3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms