Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx15Q91WE1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms