Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms