Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usb1Q91W78 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms