Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms