Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms