Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx9Q91VH2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms