Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms