Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cabp4Q8VHC5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cabp4Q8VHC5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms