Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8VDP2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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