Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC48

Pex12, Peroxisome assembly protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex12Q8VC48 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pex12Q8VC48 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pex12Q8VC48 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pex12Q8VC48 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pex12Q8VC48 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pex12Q8VC48 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pex12Q8VC48 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms