Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b4Q8QZY9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms