Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Colec12Q8K4Q8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Colec12Q8K4Q8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms