Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolbQ8K409 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms