Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
OptnQ8K3K8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms