Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms