Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap2Q8K389 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap2Q8K389 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms