Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Fbxo18Q8K2I9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Fbxo18Q8K2I9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Fbxo18Q8K2I9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Fbxo18Q8K2I9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Fbxo18Q8K2I9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Fbxo18Q8K2I9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo18Q8K2I9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Fbxo18Q8K2I9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Fbxo18Q8K2I9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo18Q8K2I9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms