Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Neil3Q8K203 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Neil3Q8K203 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms